Он умеет предсказывать не только структуру белков, но и то, как препараты будут взаимодействовать с ними.
Лондонская компания Isomorphic Labs, созданная как биофармацевтический спин-офф Google DeepMind (от англ. spin-off — "отпочкование"), представила новый мощный искусственный интеллект для разработки лекарств — Isomorphic Labs Drug Design Engine (IsoDDE). Компания опубликовала отчет на 27 страниц, раскрывающий достижения системы, однако не раскрыла детали алгоритмов, засекретив технологию.
Как отмечает BioPharmaTrend, новый ИИ позиционируется как "движок" для ускоренного проектирования лекарств. Он умеет предсказывать не только структуру белков, но и то, как потенциальные лекарства будут взаимодействовать с ними. Технология включает расчеты структуры комплексных соединений, анализ того, где на поверхности белка может "прилипнуть" препарат, а также оценку связывающей силы и моделирования антител.
Результаты тестов показывают впечатляющую производительность: по точности прогнозов структуры взаимодействия "белок-лекарство" при выполнению ряда сложных задач IsoDDE превосходит AlphaFold 3 более чем вдвое. В частности, IsoDDE сильнее в предсказании интерфейсов между антителами и антигенами. Сообщается также о достижениях в выявлении IsoDDE "криптических" (от греч. kryptos — "скрытый", "тайный") участков белков и оценке силы соединений, что раньше требовало дорогостоящих моделирований.
Стоит отметить, что AlphaFold 3 и сам стал большим шагом в биологии — он способен точно моделировать трехмерные структуры белков и других молекул, таких как ДНК и РНК. Эта технология, созданная совместно DeepMind и Isomorphic Labs, заслужила внимание научного сообщества и значительно ускорила ход фундаментальных исследований.
Однако отличие IsoDDE в том, что это интегрированная система, ориентированная на практические задачи при разработке лекарств. В отчете утверждается, что движок уже применяют внутри компании для поиска новых мишеней, оценки участков связывания и генерации потенциальных лекарственных препаратов с высокой вероятностью успеха.
Однако, в отличие от AlphaFold, который был доступен широкой научной общественности и подробно описан в академических публикациях, IsoDDE остается проприетарным (от англ. proprietary — "частный", "собственнический"). Техническая документация содержит мало подробностей о том, как достичь подобных результатов другим исследователям, что вызывает вопросы о доступности инструментов ИИ для всего научного сообщества.
Isomorphic Labs основана в 2021 году как подразделение компании Alphabet (Google) и с тех пор привлекла значительное финансирование, включая $600 млн внешних инвестиций для расширения своих программ и технологий. Среди партнеров компании — крупные фармацевтические холдинги, такие как Eli Lilly и Novartis.
IsoDDE может стать ключевым звеном в производстве лекарств, разработанных ИИ. Однако закрытый характер модели вызывает обсуждение о балансе между коммерческой выгодой и открытым доступом к научным инструментам, которые могли бы ускорить разработку медикаментов во всем мире.
комментарии